Hypothalamus' funktion kan sammenlignes med termostaten på en radiator: I hypothalamus sammenlignes kroppens temperatur med den temperatur, der (ubevidst) er ønsket i kroppen. Er den aktuelle temperatur forskellig fra den ønskede, iværksætter hypothalamus den nødvendige justering. Kroppens temperatur varierer med cirka 0,5°C i døgnet, idet "indstillingen" i hypothalamus ændres i løbet af døgnet: Temperaturen er højest sidst på eftermiddagen.

Kroppens temperatur holdes omkring det ønskede ved at justere balancen mellem varmedannelse og varmeafgivelse. Varmeproduktionen stammer fra cellernes stofskifte, mens varmeafgivelsen opstår ved udveksling af varme mellem kroppen og omgivelserne.
http://www.brs.dk/laereboeger/fh/Kap173.html

I mellemhjernens hvide substans er indlejret talrige områder med grå substans. De vigtigste af disse områder er thalamus, hypothalamus og hypofysen.

Under thalamus findes hypothalamus. Her findes en lang række centre med stor betydning for opretholdelse af kroppens indre miljø og fortsatte beståen. Det er således her centrene for regulering af appetit, temperaturbalance, vand/salt-balance og stofskifte skal findes. Reguleringen af alle disse parametre udføres ved at regulere aktiviteten i det autonome nervesystem.
http://www.brs.dk/laereboeger/fh/Kap093.html#wp1008642